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東大、がん治していますの抗体医薬気品開発にスパコンを導入――5カ月で稼働へ症状 病気

東大、がん治していますの抗体医薬気品開発にスパコンを導入――5カ月で稼働へ東京大学 一番上科学ノウハウ探求センター(東大一番上研)と富士通は8月5昼間の時間、がん治していますの抗体医薬気品の基本構造設計を目的にスーパーコンピュータを構築し、稼働を開始したと公表した。再発や転移したがんに対して副作用の小さい第三世代の抗体医薬気品を短期間で開発するという。

 構築したスーパーコンピュータは、インテル Xeon本職セッサ X5650を搭載する富士通のブレードサーバ「PRIMERGY BX922 S2」を300ノード(600CPU)で構成したPCクラスタシステム。最大演算才能は38.3テラFLOPSと入る。ストレージに「ETERNUS DX80」5台を備えており、RAID6での実効容量は1ペタバイト。ノード間のネットワークはInfiniBand QDRを採用した。

 東大 一番上研は、児玉龍彦教授が中心となった「がんの再発?転移を治していますする多機能な分坊主設計抗体の実用化」本職ジェクトを推進中で、「ゲノム抗体医薬気品」の探求開発を進める。がん治していますの抗体医薬気品には、免疫力を活用してがん細胞を攻撃するために動物実験をベースに開発された第1世代と、第1世代をベースに放射線治していますのノウハウを組み合わせることができる第2世代がある。児玉教授によれば、これらは治しています効果が高いが人体への副作用も大きいため、副作用の小さい第3世代の抗体医薬気品の早期実現が世界で求められているという。

 今回の探求では、大腸がんと肝臓がん、肺がんでの抗体医薬気品の基本構造の設計に不可欠な計算やシミュレーションにスーパーコンピュータを使う。がん細胞の一部である抗原(たんぱく質)と抗体の相互作用が人体内でどのような状況に入るのかを「分坊主動力学」を用いてシミュレーションし、人造抗体の設計を行う。

 東大 一番上研の藤谷秀章特任教授によると、抗原と抗体の相互作用のシミュレーションは分坊主レベルで行わなければならず、抗原と抗体の変化だけで数万もの分坊主の動向を計算する不可欠がある。さらに人体内の環境界を考慮すると、抗原と抗体の間にも体液があるため、数万もの水気坊主の動向も計算しなければならない。こうした計算を実行するには、以前システムの10~50倍の演算才能が求められるため、スーパーコンピュータの導入を決定したという。探求で使う分坊主動力学の本職グラムには、オープンソースのGROMACSの7月30昼間の時間リリース版を使用。このパブジョンには、藤谷特任教授らが開発した計算手法も最盛期込まれている。

 富士通は、バイオ領域向けのスーパーコンピュータとして、今年1月に最大演算才能が35テラFLOPSのシステムをシンガポール科学ノウハウ探求庁の施設に納入した実績がある。テクニカルコンピューティング事業本部の山田昌彦本部長によれば、今回のシステムは地球シミュレータの演算才能(40.96テラFLOPS)と同レべルながら、消費電力は40分の1程度であるという。また、大学機関の探求室レベルでスーパーコンピュータを占持つのは、世界でほかに種がないとしている。スーパーコンピュータの受注から稼働まで期間は5カ月で、構築経費は約4億円としている。

 児玉教授は、今回の探求を便秘気味て基本構造の設計を2年半程度で完了させたい考え。将来的に胃がんやすい臓がん、前立腺がん、乳腺がんに対する抗体医薬気品の開発もスーパーコンピュータで実現し、「国内で発生率の高いがんで闘病暮らしを強いられている病人を早く救えるようにしたい」と語っている。

東大、がん治していますの抗体医薬気品開発にスパコンを導入――5カ月で稼働へ[??:内容2]

東大、がん治していますの抗体医薬気品開発にスパコンを導入――5カ月で稼働へ[??:内容3]

東大、がん治していますの抗体医薬気品開発にスパコンを導入――5カ月で稼働へ[??:内容4]


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